目前危害商洛地区核桃的主要病虫害有核桃举肢蛾、芳香木囊蛾、核桃横沟象、核桃小吉丁、核桃炭疽病、核桃细菌性黑斑病、核桃长足象甲、核桃溃疡病、根结线虫病及核桃瘤蛾、黄须球小蠹、草履介壳虫等。
通过多年实践，采取农业生态防治措施比较有效。该方法灵活、多样、经济、简便，在核桃生长期内，结合生态环境实际进行栽培管理，不需要特殊的设备和器材，还可以减少劳动投资和生产费用，即可收到很好的防治核桃病虫害效果。
一、选育抗病虫的品种，选育抗病虫品种是预防病虫的重要一环。同一树种由于经过长期的自然选择和人工选择，形成了各种不同的品种，其性状不同，抗病虫的能力也不同。中国林业科学院利用华北核桃和新疆核桃进行杂交，对试验的第一代杂种苗抗病性的田间测定，子代的发病程度有减轻的趋势，而且个体间的差异较大。
二、进行合理的栽植及管护，合理栽植及管护是防治核桃病虫害的重要措施。栽培措施必须与核桃的生产技术措施保持一致，因为只有满足核桃生长发育的要求，同时兼顾防止病虫发生的技术措施，才能达到速生、丰产和优质的目的。
1．选择园址。在核桃定植以前，要做好园地的选择和规划工作。要选择适宜核桃生长的土壤及环境，使树体生长健壮，以免除或减少病虫的危害。当核桃栽植在过分黏重的土壤中时，根群不能正常生长，树势必然衰弱。若栽植于土壤瘠薄的山坡上，水土流失严重，根系外露，树势较弱。树势弱其抵抗病虫危害的能力就差，容易出现病虫害。因此，建立核桃园之前，要做好核桃园规划，加强核桃园管理，为其创造良好的生长条件。
2．调查病虫。核桃苗栽植前，还应对土壤的病虫害进行调查。地下病虫害严重时，应先防治再栽植。栽植前，要深耕、细整，防止园内积水，以减轻根部病害和落叶病害的发生。同时也为今后的病虫防治工作打下良好的基础。
3．配栽品种。定植的核桃苗木宜选用抗病品种和健壮无病虫的苗木，要整齐一致，保持一定的株行距，从而有利于通风透光和机械化作业。在核桃园间种植绿肥及矮秆作物，可以提高土壤肥力，丰富物种多样性，提高天敌控制效果。
4.加强管护。大部分核桃园立地条件较差，土质瘠薄，缺乏养分和水分。在这种条件下，要获得核桃的优质高产，就必须改变管理模式，把粗放管理模式转变为集约管理模式，适时适度地进行修剪，加强土、肥、水管理，控制负载，增强树势，进而提高树的抗病能力。①土肥水管理。核桃举肢蛾的发生与环境有直接关系，凡核桃园不耕种、杂草丛生的地块，发生核桃举肢蛾的现象就严重；而树下进行冬翻、夏季轻耕或种植农作物的，核桃举肢蛾危害就较轻。春季通过刨树盘，铲除杂草，疏松土壤，可减轻核桃举肢蛾的发生，并能消灭在地下越冬的害虫，也可减少褐癍病、白粉病等病害的病源，同时提高树体对腐烂病等多种病害的抵抗力。②科学修剪。科学修剪是生产无公害果品的一项关键技术。通过冬季修剪改善树体结构，增加结果部位，同时可将在枝条上越冬的卵、幼虫、越冬茧等剪去，以减轻翌年病虫害的发生。利用夏剪，可改善树体通风透光条件，减少树干腐烂病、落叶病等病虫害的发生及蔓延。
5．清洁果园。被病虫危害过的核桃树，其枯枝落叶和病果常是病虫次年危害的主要来源。在深秋或冬季对核桃园地进行垦覆、翻耕 ,可杀死在地下越冬的金龟子、举肢蛾、核桃缀叶螟等害虫 ,清理剪下的病枝、枯枝落叶、果皮、落果及杂草 ,并集中烧毁或沤埋做肥 ,以减少越冬病虫源 ,因清除杂草 ,可以蓄水保墒 ,提高土壤肥力 ,增强树势和抗病虫害能力。
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